Кобайрский монастырский комплекс (XII-XIIIвв.) находится в Лорийском марзе, на крутых возвышенностях склона ущелья реки Дебед. Кобайрский монастырь был важным культурным очагом и центром переписки. Как обитель был сформирован в первой половине XIIIв. К тому времени он уже перешел от Кюрикидов к Закаридам и принял халкедонство.
Основной комплекс состоит из трех церквей, колокольни-усипальницы, столовой, часовен, хачкаров и руинов крепостной стены. В окружающих скалах находятся труднодоступные пещеры и убежища. На восточном фасаде большой церкви (конец XIIв. - начало XIIIв.) примечателен покрытый плетеным орнаментом крест охватывающей почти всю высоту фасада. Позднее, с севера были пристроены часовня-придел и портик.
Однонефная сводчатая церковь Мариамашен находится в восточной части большой церкви, на краю обрыва. Она была построена в 1171г. дочерью царя Кюрике II - Мариам (старейшее из сохранившихся сооружений).
Колокольня-усыпальница, находящаяся в средней части комплекса, была построена в 1279г.
Столовая (XIIIв.) размещается в северо-западной возвышенной части большой церкви. Однонефная церковь (XIIIв.) находится к северу от монастыря. Руины крепостной стены, высотой 4-5м, сохранились в северной и северо-восточной части. Главный вход представляет собой сводчатый проем в стене с парой башен по бокам.
Монастырь Кобайра прославлен своими высокохудожественными фресками, которые украшают большую церковь, часовню-придел, колонный зал и колокольню-усыпальницу. Лучше всех сохранились фрески над алтарем большой церкви, где изображены Богородица, рядом архангелы, ниже, двумя рядами «Причащение» и святые, на стене алтарного возвышения - пророки. На западной стене и на нижнем ряду северной стены сохранились портреты заказчиков. Выше портретов северной стены проглядывается картина «Успение Богородицы». Около нее есть плохо сохранившиеся эпизоды, которые, по-видимому, относятся к жизни Богородицы.
Художественные особенности фресок этих двух церквей имеют много сходств, которые свидетельствуют о том, что их рисовали мастера одной мастерской. За счет исключительной художественной ценности Кобайрские фрески являются значимыми памятниками средневековой армянской монументальной живописи.